Ten etap rehabilitacji po zabiegach kardiochirurgicznych u chorych bez powikłań powinien się rozpocząć po około 2 tygodniach od zakończenia hospitalizacji i trwać 3-5 tygodni; w przypadku wystąpienia powikłań zostaje wydłużony. Może on być realizowany w warunkach stacjonarnych (oddziały rehabilitacji), jako rehabilitacja hybrydowa (1-2 tygodnie na oddziale stacjonarnym, następnie telerehabilitacja domowa) lub w ambulatoryjnych ośrodkach rehabilitacji kardiologicznej, wyposażonych zgodnie ze standardami PTK w sprzęt i mający odpowiednią kadrę. Istotną rolę w realizacji II etapu odgrywają psycholog i ukierunkowana rehabilitacja psychiczna.